Έρευνα σε βάρος του Skype διεξάγει ο Επίτροπος του Λουξεμβούργου για την προστασία προσωπικών δεδομένων, σχετικά με πιθανή μυστική ανάμιξή του στο αμφιλεγόμενο πρόγραμμα παρακολουθήσεων Prism, της αμερικανικής Υπηρεσίας Εθνικής Ασφάλειας (NSA).
Το Skype, το οποίο εδρεύει στο Λουξεμβούργο, όπως και πολλές άλλες δημοφιλείς τεχνολογικές εταιρείες (Amazon, Netflix κλπ), μπορεί να βρεθεί αντιμέτωπο με σοβαρές ποινικές και διοικητικές κυρώσεις, εφόσον βρεθεί να έχει παραβιάσει τη νομοθεσία της χώρας σχετικά με την προστασία του απορρήτου.
Το Σύνταγμα του Λουξεμβούγου είναι ιδιαίτερα αυστηρό σε ζητήματα παρακολουθήσεων, προστατεύοντας πλήρως το δικαίωμα στην ιδιωτικότητα και ορίζοντας, ότι παρακολουθήσεις μπορούν να πραγματοποιηθούν μόνο με δικαστική ή πρωθυπουργική έγκριση.
Η δημοφιλής υπηρεσία, η οποία δημιουργήθηκε το 2003, ως ένα εργαλείο ασφαλών διαδικτυακών επικοινωνιών, αντιμετωπίζει πλέον επίσημα την εμπλοκή του με το σκάνδαλο των παρακολουθήσεων της αμερικανικής κυβέρνησης. «Οι μόνοι χαμένοι είναι οι χρήστες», δηλώνει χαρακτηριστικά o Eric King, επικεφαλής της ομάδας ανθρωπίνων δικαιωμάτων, Privacy International, «το Skype προωθήθηκε ως εργαλείο ασφαλούς επικοινωνίας, ωστόσο φαίνεται ότι δεν μπορεί πια να εγγυηθεί την προστασία των συνδρομητών του».